r - 系統発生ノードの順序

Question

言語系統学を使用して R でいくつかのプロットを作成しています。系統発生の末端ノードの後に​​正方形の行をプロットし、それらに色を付けて変数の数を表したいと思います。

正方形を作成しましたが、正しい順序で色を付けるのに問題があります。

「phylo」オブジェクトはノード ラベルをアルファベット順に並べますが、アルファベット順にはプロットされません。チップ ラベルの順序を、系統発生にプロットされた順序 (上から下または下から上) で取得する方法はありますか?

ありがとう、

サム

Answer 1

系統発生をファイルに保存して再度読み込むと、ヒント ラベルがリセットされ、プロット時に表示される順序になります。