SIFT を使用しようとするとセグメンテーション違反が発生する理由を解読しようとしています。
テスト fasta ファイルと、提供されている代替ファイルを使用しています。私は自分のシステムで正常に BLAST できる swissport データベースを使用しています。
SIFT を使用しようとすると、次のようになります。
arron@arron-Ideapad-Z570 ~/Phd/programs/sift4.0.3b $ bin/SIFT_for_submitting_fasta_seq.csh test/lacI.fasta db/swissprot.fa test/lacI.subst 2.75
tail is lacI.fasta
query is /home/arron/Phd/programs/sift4.0.3b/tmp/lacI.fasta.query
query length 360
entered read_psiblastuntillat
Segmentation fault
tell me i've entered
info_on_seqs
fawegwa
cannot open file /home/arron/Phd/programs/sift4.0.3b/tmp/lacI.alignedfasta
Output in /home/arron/Phd/programs/sift4.0.3b/tmp/lacI.SIFTprediction
過去 2 時間、エラーが処理されているソース コードを見つけようとしましたが、うまくいきませんでした。SIFT セグメンテーション違反の経験がある人はいますか? または、ソース コードを教えて、何が問題なのかを確認できますか?
どうもありがとう。