私は、ゲノム/gtf データを FASTA ファイル形式に変換する作業を行っています。そのためにフラックスシミュレーターを使用しています。フラックス シミュレーターのデモ例は問題なく動作します。その後、http://hgdownload.soe.ucsc.edu/downloads.html、https://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables?command=startからゲノムと gtf データをダウンロードしました。
しかし、mouse(mm9) gtf の実行中はまったく機能せず、次のエラーが表示されます: [ERROR] Error while loading stats: Field 5 not found java.lang.IllegalArgumentException: Field 5 not found
また、「ハエ」ゲノムのフラックスシミュレーターを実行しようとしました。
このエラーが発生しました: [INFO] トランスクリプト シーケンスを準備するデフォルトの PCR ディストリビューションを読み込んでいます ** エラー [エラー] シーケンスの準備中にエラーが発生しました: [エラー] 断片化中にエラーが発生しました: シーケンス chr2L を読み取る際の問題: pos 22877860、len 82、染色体シーケンスが存在するかどうかを確認してください / java.lang.RuntimeException: シーケンス chr2L の読み取りに問題があります: pos 22877860、len 82、
これらの問題を解決する方法を教えてください。