cluster-computing - クラスターへの rstan のインストール

Question

クラスターに rstan をインストールする場合、ビルドに使用するコアの数をどのように選択する必要がありますか (ドキュメントSys.setenv(MAKEFLAGS = "-j4"で説明されている行で)。クラスター内の各ノードに 16 個のコアがある場合、値を 16 に設定する意味はありますか? ユーザーが MPI を使用して複数のノードで stan を実行したい場合はどうなりますか? それとも、どのような場合でも値を 4 にしておくのが最も理にかなっているでしょうか。ほとんどの人はとにかく 4 つ以下のチェーンを並行して実行するだけなのでしょうか? この設定に関するアドバイスをいただければ幸いです。

Answer 1

完全を期すために、John が Stan-users メーリング リストに投稿したときの質問に答えました。つまり、ビルド時に使用されるコアの数は問題ではありません。R (または Stan へのその他のインターフェイス) でサポートされている任意の並列スキームを使用して、実行時に任意の数のコアを使用できます。