もう一度あなたの助けが必要です:)
タブで区切られた特定のtxtファイルまたはxlsファイルからヒートマップを生成するRスクリプトを作成しました。現時点では、ヒートマップに含めたくないすべての列をxlsファイルで手動で削除しています。今、私はそれを自動化したいのですが、方法がわかりません:(
興味深い列はすべて、すべてのxlsファイルで同じように始まり、その後に個別の名前が続きます。
xls-ファイル1：L1_tpm_xxxx L2_tpm_xxxx L3_tpm_xxxx
xls-ファイル2：L1_tpm_xxxx L2_tpm_xxxx L3_tpm_xxxx L4_tpm_xxxx L5_tpm_xxxx
それらの列を選択する方法はありますか？
期待してありがとう、フィリップ
次を使用できます（data.frameでデータを読み取った場合df）：
df <- df[,grep("^L[[:digit:]]+_tpm.*",colnames(df))]
または、必要な列を明示的に書き込むことができます。
df <- df[,c("L1_tpm_xxxx","L2_tpm_xxxx","L3_tpm_xxxx")]
等...
次のリンクは非常に便利です;-)
列の位置がExcelシート全体で固定されると思われる場合、ここでの最も簡単な解決策は、列のインデックスを使用することです。たとえば、read.tableを使用してタブ区切りのテキストファイルをdata.frameとしてインポートし、最初の2列のみを保持することにした場合は、次のようにします。
data <- read.table("path_to_file.txt", header=T, sep="\t")
data <- data[,1:2]