sql - 2 つのデータ フレーム間の部分的な一致を見つける

Question

2 つのデータ フレームがあります。

head(NEexp)
 Gene   Transcript Ratio_log2      FDR
HLHmgamma HLHmgamma-RA   3.759200 1.09e-10
Brd       Brd-RA   3.527000 2.66e-08
CG4080     CG4080-RE   3.378500 2.95e-50
RpII215   RpII215-RA   3.343967 1.82e-10

head(excel$gene)
Enhancer of split mgamma, helix-loop-helix
distal antenna
CG4080 gene product from transcript CG4080-RB

ご覧のとおり、2 つの遺伝子列は部分的に一致します (HLHmgamma は分割 mgamma のエンハンサー、helix-loop-helix に一致します。CG4080 は転写産物 CG4080-RB からの CG4080 遺伝子産物に一致します)、これら 2 つをリンクできる方法はありますか? これまでに試したコード:

genename=as.character(NEexp$Gene)
query=paste("select * from excel where excel.gene LIKE \"", genename,"\ ",sep"")
Newtable<-dbGetQuery(con,query)

dbGetQuery(con,"select * from excel, NEexp where excel.gene LIKE % "NEexp$Gene" %")

Answer 1

が必要ですmerge。これは基本的joinに SQL と同じです。ただし、最初にexcel$gene、一致させたい部分を取得するために分割することをお勧めします。

http://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/merge.html

https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/strsplit.html