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二倍体植物種のGWASにGenABELを使用したいのですが、フェノファイルに「性別」列が必要なため、GenABELは固執しました。男性は「1」、女性は「0」で埋めてください。しかし、私は植物種を扱っています。私は何をすべきか？

R のエラー:

impute <- load.gwaa.data(phe="traits.dat", gen="gen0tped.raw", force=TRUE)

if (length(a) == 1 && !(names(a)[1] == 0 || names(a)[1] == 1)) stop("the column named \"sex\" contains のエラー0 (=女性) でも 1 (=男性) でもない 1 つのコード") : TRUE/FALSE が必要な場所に欠損値

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の詳細セクションから?load.gwaa.data:

表現型ファイルの最初の列には、「id」という名前の被験者の一意の ID が含まれている必要があります。また、「sex」という名前の列があり、性別情報 (0 = 女性、1 = 男性) を提供する必要があります。ファイル内の他の列には、表現型情報が含まれている必要があります。欠損値は「NA」でコーディングする必要があります

したがってsex、すべての値を として列を含めてみてくださいNA。

また、メンテナ ( packageDescription("GenABEL", fields = c("Maintainer", "BugReports"))) に連絡して、GWAS は性別に関係のないものでも実行できることを説明してください。

于 2015-05-13T05:16:04.117 に答える