ビーガンで関数 ordihull を使用して、叙階のグループをプロットしたいと思います。ただし、1 回しか出現しないサイトがいくつかあります。ordihull を使用すると、このサイトはプロットに表示されません。以下の例を参照してください。1 つのサイトのみが BF を管理している場合です。欲しいのは、残りの1つのBF管理サイトが叙階プロットにあるBFレーベルです。
library(vegan)
data(dune)
data(dune.env)
#remove all but one row with BF as management
dune <- dune[-c(2,11),]
dune.env <- dune.env[-c(2,11),]
mod <- cca(dune ~ Management, dune.env)
attach(dune.env)
plot(mod, type="n", scaling = 3)
pl <- ordihull(mod, Management, scaling = 3, label = TRUE)