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bash スクリプトを使用して pymol コンソールでコマンドを実行したいのですが、どうすればよいですか? 以下は私のコードですが、機能していません。

#!/bin/bash
##
## PyMOL startup script
##

# Set PYMOL_PATH to point to this directory
export PYMOL_PATH="$(dirname "$(readlink -f "$0")")"

# other environment variables
export PYTHONHOME=$PYMOL_PATH/ext
export PYTHONPATH=$PYTHONHOME/lib/python2.7:$PYTHONHOME/lib/python2.7 /lib-tk:$PYTHONPATH
export LD_LIBRARY_PATH=$PYMOL_PATH/ext/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export LANG=C

# binary executable
exec $PYMOL_PATH/pymol.exe "$@"
exec cmd.load("1a4g.pdb") 
exec cmd.quit()
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bash スクリプトで PyMOL スクリプトを作成するだけです。

#!/bin/bash

$PROT1="1a4g"
$PROT2="1ogg"

#create the script
echo "fetch $PROT1
fetch $PROT2
select *" > script.pml

# GO!
pymol script.pml

または、pymol 自体からスクリプトを開始する場合 ( PyMOL wiki )

于 2015-06-19T09:43:27.023 に答える