これまで R を使用したことはありませんでしたが、過去数か月間、Spatstat を使用してがん組織の細胞分布を分析しました。2 つの異なる細胞集団の陽性染色細胞の xy 座標を抽出して、顕著な ppp を生成します。密度プロットや K/G 交差関数などを使用してデータを視覚的に調べると、2 つの細胞集団の分布が強度の点で異なる場合が特定されます。さらに、細胞が互いに排他的であるように見える場合もあれば、両方の集団が共有する「ホットスポット」によって特徴付けられる場合もあります。ただし、イラストとして横に並べた画像を使用する以外に、これを示す最善の方法がわかりません。2 つの密度プロットを統合したり、強度の共有領域のグラフを作成したりする方法はありますか? または、見逃したSpatstatの別の機能はありますか?
これがばかげた質問ですが、物事を進めるのに苦労している場合はお詫びします。アドバイスをいただければ幸いです。
よろしく、マット