私は、さまざまな生理学的プロセスが発生する組織層の生物学的に正確な 2D 空間モデルを作成しようとしています。これには、主に化学反応、拡散、および境界を越えるフラックスが含まれます。
私はこのモデルを COMSOL Multiphysics で作成しています。COMSOL Multiphysics は、反応拡散システムなどのさまざまな物理を解く有限要素ソフトウェア パッケージですが、私の質問には関係ないかもしれません。
私のジオメトリでは、組織層の細胞間に非常に小さな領域があります。これらの領域は、セル間で拡散が発生する開口部 (接合部) として機能します。ここではメッシュの品質が良くありません。品質を改善したい場合 (主に要素を追加するなどして)、シミュレーション時間が大幅に増加します。メッシュの品質が低いと、収束に時間がかかります。アイデアを与えるためにジオメトリの写真を追加しました。さまざまなメッシュを試しましたが、すべて要素の品質が異なり、要素の数が 16000 から 50000 の範囲でした。
私の FEM のバックグラウンドは本当に限られているので、この問題に取り組めるかどうかを知りたいと思っていました。
- 生物学に悪影響を及ぼさない (組織ドメインのサイズ/問題などを可能な限り生物学的に正確に保つ)、
- シミュレーション時間が大幅に増加することはありません。
- メッシュ品質を向上させます。
ですから、私はすでにいくつかのことを考えているので、最善の方法が何であるかを知りたいと思っています.
最適な生物学的精度のために小さな領域を維持し、比較的短い計算時間を確保できるように、品質の低いメッシュを使用できますか (これはそれほど悪くはありませんが、良くもありません) (収束に至らないことを願っています)。エラー)。しかし、おそらく私が見逃している可能性があります。たとえば、小さなドメインを大きくして、拡散率に何らかの要因を追加することは可能ですか. つまり、ドメインを 2 倍にしたい場合、拡散率を 1/2 にすればよいのでしょうか。それは化学/物理法則でも正確ですか:S.
うまくいけば、私は問題を少し明確にし、助けてくれてありがとう.
乾杯、
組織モデルのメッシュ
