RStudio メニューから [ File ] > [ New File ] > [ R Markdown ... ] を選択し、[ Presentation ] 、 [ HTML (Slidy) ] を選択します。
サンプル コードを残してKnit HTMLを押すと、(保存後に) RStudio ブラウザーでプレゼンテーション モードでプレゼンテーションが開きます。ただし、[ブラウザーで開く] を選択すると、プレゼンテーションが 1 ページとして表示され、"a" を押してスライド ショー モードに変更しても機能しません (Chrome と IE でテスト済み)。
HTML (ioslides) を選択した場合、これと同じ動作は発生しません。つまり、ioslides は期待どおりに動作します。
他の誰かがこの問題を再現できますか? 何か案は？どうやらjavascriptが有効になっているようです...