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pdb構造2a65を読む 「タンパク質の一部」ではなく「タンパク質のリガンド」と見なすべきアミノ酸残基のケースに直面しています。

PDB ファイルと cif ファイルでは、この LEU.601 残基は HET としてタグ付けされていますが、残念ながら LEU という名前であるため、Biojava が自動的に ATOM としてタグ付けしているようです。「タンパク質鎖A」とリガンド「LEU.601」を区別する方法を知っている人はいますか?

2a65.pdb のサンプル:

HETATM 4149  N   LEU A 601      24.537  32.416  18.866  1.00 15.26           N
HETATM 4150  CA  LEU A 601      25.812  31.696  18.815  1.00 16.66           C
HETATM 4151  C   LEU A 601      25.693  30.381  18.046  1.00 16.48           C
...

私の biojava コードのスニペット:

Group g=s.findGroup("A", "601");
System.out.println(g);
System.out.println(g.getType());

g=s.findGroup("A", "701");
System.out.println(g);
System.out.println(g.getType());

そしてそれが生成するもの:

AminoAcid ATOM:LEU L 601 true ATOM atoms: 9
amino
Hetatom 701 BOG true atoms: 20
hetatm
4

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