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私はbiomFreeBSD のパッケージ (2.1.5) に取り組んでいます。

ドキュメントに基づいて、最初は と に依存していましたが、掘り下げるpynumpyとh5py、以下にも依存する必要があると思います。

py27-click-6.6
py27-future-0.14.3
py27-pyqi-0.2.0
py27-scipy-0.16.1.

biom今、実行すると以下のエラーが発生するところまで来ました。デバッグに関する提案はありますか? 私は Python 開発者ではないので、お手柔らかにお願いします。

Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/bin/biom", line 9, in <module>
    load_entry_point('biom-format==2.1.5', 'console_scripts', 'biom')()
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 547, in load_entry_point
    return get_distribution(dist).load_entry_point(group, name)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 2720, in load_entry_point
    return ep.load()
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 2380, in load
    return self.resolve()
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/pkg_resources/__init__.py", line 2386, in resolve
    module = __import__(self.module_name, fromlist=['__name__'], level=0)
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/biom/__init__.py", line 51, in <module>
    from .table import Table
  File "/usr/local/lib/python2.7/site-packages/biom/table.py", line 188, in <module>
    from future.utils import string_types
ImportError: cannot import name string_types
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string_types将来の 0.14.3 では、ありませんfuture.utils。（ドキュメントには記載されていますが）。今後の github リポジトリ0.14.xのブランチを見てください。

執筆時点で、将来のモジュールの現在のバージョンは 0.15.2 です。そのため、バイオムが機能する前にそのポートを更新する必要があります。そのポートの管理者に連絡することをお勧めします。

于 2016-05-26T05:48:37.857 に答える