同じ行に配置された 2 つのグループのデータ ポイントと、複数行のデータ (400k+) があります。これらの 400K+ 行のそれぞれについて、2 つのグループの分散を比較したいと思います。データは次のようなものになります-
y<-rbind(c(1,2,20,50,100,1,2,3,1,2),c(20,2,80,50,100,1,2,3,1,2))
group<-structure(c(1L,1L,1L,1L,1L,2L,2L,2L,2L,2L), .Label = c("T","C"), class="factor")
たとえば、単一行のデータでパッケージleveneTest
から実行できます-car
leveneTest(y = y[1,], group = group) # first row of data
Levene's Test for Homogeneity of Variance (center = median)
Df F value Pr(>F)
group 1 4.527 0.06603 .
8
また
leveneTest (y = y[2,], group = group) # second row of data
Levene's Test for Homogeneity of Variance (center = median)
Df F value Pr(>F)
group 1 11.92 0.008662 **
8
しかし明らかに、これは 40 万行以上のデータには非現実的です。
apply
たとえば、 の場合と同じようにを使用するような単純なものになると思いましたt.test
-
apply(y, 1, function (x) t.test(x[1:5],x[6:10])$p.value)
[1] 0.15260837 0.05551746
しかし、私が試してみるとleveneTest
apply(y, 1, function(x) leveneTest (y = y, group = group))
次のエラーが表示されます
Error in complete.cases(y, group) :
not all arguments have the same length
これを行う方法を知っている人はいますか?