のグローバルオプションを使用して、.rmd ファイルを html または pdf_documents に正常にコンパイルしていますdev='tikz'。残念ながら、結果として得られる .tikz ファイルにはラテックス本体が含まれているため、それらを lyx の子ドキュメントとして含めることができません。
TikZDevice -ManualstandAloneは、 -option がこれを担当していることを示しているようです。
このオプションを RMarkdown 内から (グローバルに) 制御することは可能ですか?それとも、各コード チャンクで tikz を直接呼び出す必要がありますか?