私は knime を初めて使用し、この* OpenMS 質量分析ワークフローを OpenMS-Knime ワークフローとして再作成しようとしています。OpenMS ワークフローは、もともと OpenMS コマンド ラインで手動で実行されていました。
私が今遭遇しているバンプは、紙の状態です...
[OpenMS PeakPickerHiResを使用して計算しました] S/Nフィルターを無効にしたプロファイル質量スペクトルからのピークの重心...
したがって、OpenMS の Knime 実装には、正しい PeakPickerRes ノードと、すべての正しい構成パラメーターがあります。ただし、アルゴリズム フィルターには、単純に「無効」にするオプションがないようです。おそらく、多かれ少なかれ機能しないように設定できる構成項目がありますが、ノードを手動で編集して（コードまたは別の方法で）機能を完全に無効にする方法があるかどうか疑問に思っています。
- 張ら。2014 - 高解像度データ依存型タンデム質量分析における共断片化ペプチドの効率的な同定のための DeMix ワークフロー