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Google Genomics ReadGroupSets を使用してアラインメント データ (BAM ファイル) を保存していましたが、昨日までは驚くほど実行されていました...

昨日 (2016 年 8 月 29 日)、インポート ジョブ (メソッド: readgroupsets.import ) は「実行中」ステータスを開始しましたが、今まで「完了」またはエラー メッセージを達成していませんでした。

他の誰かが同じ問題を抱えていますか?

例: ジョブは 1 日間実行され、エラー メッセージは表示されません。

$ gcloud alpha genomics operations describe identifier

done: false
metadata:
  '@type': type.googleapis.com/google.genomics.v1.OperationMetadata
  clientId: ''
  createTime: '2016-08-30T01:08:57.000Z'
  events: []
  projectId: xxxxxxx
  request:
    '@type': type.googleapis.com/google.genomics.v1.ImportReadGroupSetsRequest
    datasetId: 'xxx'
    partitionStrategy: PER_FILE_PER_SAMPLE
    referenceSetId: ''
    sourceUris:
    - gs://xxx/yyy/zzz.bam
name: operations/identifier

昨日も、Google Storage 内のオブジェクトから「公開リンク」を取得する際に一時的な問題が発生しましたが、現在は問題ありません。

編集: gcloud cli を使用して別のデータセットと別のクラウド プロジェクトを指定してインポート ジョブをトリガーしようとしましたが、ジョブはまだ「実行中」のままです。

edit2: Google Genomics を約 3 か月使用しており、400 以上のアラインメントを正常にインポートしています。今週だけ問題があります。

edit3:解決しました。すべてのジョブが正常に終了しました。

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昨日の午後にバックログがありましたが、まだ開始段階に達していないようです。操作をキャンセルして、再度送信します。

ポール

于 2016-08-31T00:14:15.093 に答える