セットアップ (コードにコピー)
y <- iris$Sepal.Length
x <- iris$Sepal.Width
X <- cbind(1,x)
n <- nrow(X)
p <- ncol(X)
qr.X <- qr(X)
b <- (t(qr.Q(qr.X)) %*% y)[1:p] ## can be optimized; see Remark 1 below
R <- qr.R(qr.X) ## can be optimized; see Remark 2 below
beta <- as.vector(backsolve(R, b))
res <- as.vector(y - X %*% beta)
算数

計算
残余自由度はn - p
であるため、推定分散は
se2 <- sum(res ^ 2) / (n - p)
したがって、推定された係数の分散共分散行列は次のようになります。
V <- chol2inv(R) * se2
# [,1] [,2]
#[1,] 0.22934170 -0.07352916
#[2,] -0.07352916 0.02405009
検証
と比較して正しさを確認しましょうlm
。
fit <- lm(Sepal.Length ~ Sepal.Width, iris)
vcov(fit)
# (Intercept) Sepal.Width
#(Intercept) 0.22934170 -0.07352916
#Sepal.Width -0.07352916 0.02405009
同じ結果!
備考 1 (「Q」係数の形成をスキップ)
の代わりにb <- (t(qr.Q(qr.X)) %*% y)[1:p]
、関数を使用できますqr.qty
(「Q」行列の形成を避けるため):
b <- qr.qty(qr.X, y)[1:p]
備考 2 (「R」係数の形成をスキップ)
R <- qr.R(qr.X)
forを抽出する必要はありませんbacksolve
。を使用するqr.X$qr
だけで十分です:
beta <- as.vector(backsolve(qr.X$qr, b))
付録: 推定のための関数
上記は最も単純なデモです。実際には、列のピボットとランク不足に対処する必要があります。以下は実装です。X
はモデル行列で、y
は応答です。結果は と比較する必要がありますlm(y ~ X + 0)
。
qr_estimation <- function (X, y) {
## QR factorization
QR <- qr(X)
r <- QR$rank
piv <- QR$pivot[1:r]
## estimate identifiable coefficients
b <- qr.qty(QR, y)[1:r]
beta <- backsolve(QR$qr, b, r)
## fitted values
yhat <- base::c(X[, piv] %*% beta)
## residuals
resi <- y - yhat
## error variance
se2 <- base::c(crossprod(resi)) / (nrow(X) - r)
## variance-covariance for coefficients
V <- chol2inv(QR$qr, r) * se2
## post-processing on pivoting and rank-deficiency
p <- ncol(X)
beta_full <- rep.int(NA_real_, p)
beta_full[piv] <- beta
V_full <- matrix(NA_real_, p, p)
V_full[piv, piv] <- V
## return
list(coefficients = beta_full, vcov = V_full,
fitted.values = yhat, residuals = resi, sig = sqrt(se2))
}