私はRを初めて使用し、pheatmapを使用して、処理細胞と対照細胞の遺伝子発現のlog2倍の変化を視覚化し始めました。デフォルトでは、pheatmap はカラー キーの上限を 6 に、下限を -2 に設定します。4を超えるすべての値が赤の最大強度に割り当てられ、-1未満の値が青の最大強度に割り当てられ、その間の値がさまざまな強度の色に割り当てられるように色を割り当てる方法はありますか?
これは私が使用しているコードです:
pheatmap(my_matrix,cluster_cols = FALSE,cellwidth = 30,fontsize = 7,height = 40,show_rownames = FALSE)
色として使用したい：
colorRampPalette(rev(brewer.pal(n=7,name="RdYlBu")))