ここで、別の「グラフィック」の問題があります。
MOTHUR から次の距離行列を取得しました (加重ユニフラック分析から得たものです)。
20
F3D0
F3D1 0.222664
F3D141 0.157368 0.293308
F3D142 0.180278 0.319198 0.0944511
F3D143 0.157659 0.290975 0.0545202 0.0761392
F3D144 0.199909 0.34045 0.104358 0.086418 0.089473
F3D145 0.207946 0.348532 0.107841 0.076302 0.0940067 0.051632
F3D146 0.117877 0.253996 0.0891617 0.130867 0.0882064 0.134407 0.138415
F3D147 0.197256 0.336583 0.102114 0.0764106 0.0890669 0.0514887 0.0479297 0.135324
F3D148 0.173824 0.311951 0.0606815 0.0648557 0.056463 0.074914 0.0811015 0.111996 0.0709027
F3D149 0.145614 0.276632 0.0462779 0.105512 0.0628737 0.10902 0.114584 0.0739466 0.107123 0.0690412
F3D150 0.129557 0.277624 0.0840909 0.128305 0.0863231 0.140256 0.145381 0.0744572 0.13672 0.113564 0.0659831
F3D2 0.133531 0.216587 0.160832 0.186833 0.176061 0.214934 0.215261 0.152591 0.205629 0.188325 0.156313 0.153841
F3D3 0.213102 0.305651 0.123818 0.113021 0.139376 0.148558 0.13853 0.174377 0.139851 0.126329 0.131294 0.166738 0.137784
F3D5 0.128668 0.185235 0.167733 0.205183 0.176585 0.224806 0.230984 0.14497 0.223492 0.18933 0.153624 0.148617 0.127574 0.192433
F3D6 0.139411 0.236633 0.135418 0.124848 0.134198 0.175098 0.166205 0.118905 0.166144 0.151842 0.120964 0.12724 0.0950943 0.119852 0.129523
F3D7 0.198884 0.315888 0.130385 0.0989168 0.131945 0.14625 0.126203 0.173689 0.128993 0.121373 0.140199 0.152123 0.152893 0.0906675 0.186674 0.111134
F3D8 0.178656 0.18783 0.205737 0.22104 0.219858 0.268701 0.2644 0.184943 0.268051 0.229503 0.1979 0.20035 0.164427 0.203089 0.119084 0.142398 0.185551
F3D9 0.153265 0.186706 0.196143 0.21504 0.20728 0.262127 0.255558 0.174563 0.2607 0.221969 0.192437 0.185154 0.13976 0.195538 0.0973901 0.127619 0.177605 0.0558726
Mock 0.653789 0.645344 0.633297 0.623553 0.633903 0.633135 0.63394 0.635815 0.645332 0.636453 0.629143 0.646918 0.663222 0.639517 0.649722 0.64073 0.654882 0.63988 0.646155
この距離行列は PCoA に由来するので、私がやりたいことは、これらの距離を R を使用して順序付けプロットにプロットすることです。
これを行う方法について何か考えはありますか？
どうもありがとう