R で monocle パッケージを使用した経験がある場合:
サンプル名のベクトルに基づいてデータをサブセット化しようとしていますが、達成できません。
私が試してみました：
x@phenoData$sampleNames <- example.cells
しかし、私はこのエラーが発生しています:
置換には 661 行、データには 5809 行あります
サブセット化しようとしているオブジェクトは、importCDS 関数によって Seurat オブジェクトから作成されたセル データ セット (CDS) です。
また、Seurat オブジェクトの meta.data の一部であり、CDS に変換された後に phenoData の varLabels スロットの下にリストされている「CellType」と呼ばれるすべてのサンプルに Cell Type を割り当てました。
これらの変数のいずれかに基づいてサブセット化する方法を教えてください。ありがとうございます。