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現在、商用と非商用のブラスト ツールを探しています。ローカル ブラスト検索に NCBI ブラストを数回使用しましたが、現在は興味深い代替手段を探しています。検索中に、CUDA-Blast、GPU-Blast、WU-Blast、BlastStation2、mpiBlast、Turboblast などの興味深い結果が見つかりました。誰もがそれらのツールで経験したように? または、BlastStation2 など、私が見逃した同様のツールはありますか? 私が見逃した重要な商用または非商用のブラスト ツールはありますか?

本当にありがとうございました。

ありがとう、

ビース

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また、同じ比較機能などを提供する FASTA プログラムも参照してください。FASTA プログラムは BLAST 出力を生成できるため、分析パイプラインの変更は最小限で済みます。

http://faculty.virginia.edu/wrpearson/fasta

于 2012-03-02T13:40:56.210 に答える
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http://www.sequenceserver.comをチェックしてみてください。 これはオープン ソースです。これにより、Web インターフェイスを取得するローカル BLAST サーバーを迅速にセットアップすることが非常に簡単になります。(つまり、同僚と共有することもできます)。

免責事項: 私は開発者の 1 人です。

乾杯、

ヤニック

于 2011-06-13T10:57:20.143 に答える