したがって、原則として、raw カウント RNAseq ファイルを正規化するのは非常に簡単です...
しかし、生カウントのファイルには遺伝子の長さが含まれていません。
どのように/どこから遺伝子の長さをインポートし、それをアンサンブル ID に一致させることができますか? cpm 値から EdgeR rpkm を使用しています。
x_rpkm <- rpkm(x_cpm)
「rpkm.default(x_cpm) のエラー: 引数 "gene.length" がありません。デフォルトはありません」
ありがとうございました