典型的な入力.txtファイル (fasta ファイルとも呼ばれます) は次のとおりです。
>contig00001 長さ=586 numreads=4 CGGGAAATTATCcGCGCCTTCACCGCCGCCGGTTCCACCGACGAACGGATACTGCGtGaa ggCCGCGATCCCGTCggaCGGAAAaCGCCcTGGCCCGGGAaCATACCGTTCGGGCCGCCA AGTGTTATAGCCGGACCACTTGTCAGAACATTTCCaaTCCGAAGATGTGAGTtCGGAAGg TAAAAGCCCGACAAGTTGCGCGgTGAATTTACCTTtACcGCACGATATGCGTCCGTATTA ああGAAAaGTTCGAAATTATCAGTAAGGCCGACCTGAAaGCTGACCGGGAGTTCAACAAAA TCTGCATCACCcGGgTCACGGTCGAAATTGCTGTACGCGGCGCTGAACGTAAAATTCACCC TTTcTAAGGGTGTCGCcGTCGTAAACCGTAAaCAaGCCGGTAGCGCCGCCCATCGGGCCG CCGGTACCAACCGTCGGTGCCGTGTTTCTtGCATCATTGTCCGATCGAGCGTTCTCGTCC GCTTGTGCAAaTCCTGCAaTAGCTAACGTGAAAACGATCAGAGCTGTTGTAAATACTCTA TAAGCGAGATTCATCACATTCCTCcGCCGAAATAAAAAGTTAATTt >contig00002 長さ=554 numreads=4 TGCGCCAaCCGCGCTCTtCATAAaTGGGCACTGCTCCCGATGGCCgACTCGGGCGGTTCG CCATGAGATCTTTGCCtACCcAGgAaCtCACcACCAAGTCTGATTGCTGTGTGTTTtCTT CAAGTCCCTATTTCTATTCtCTTtATGGAACCCGTAGGAAACCCGTGTAGGACGCGGGA aCCGCACTTgAAGGGGGAGGCGCGGGGTACCGGtCCGGGAACGTACGGGTACCGGCGGGG gAGGGGAGGGGGACCgCTCCGGGAAGGCCAGGGGACGGATTGGGGAAGGgCGGGTACCGA AGCGGGgaAAaTGGGggAaCcGGCGAGAGGGTTCCTCGCTAAGTGGGGGAAATaGGGGAAA GGTTGACCAGTGGTtCCCcGCTCTCGTAACATGCCTCAGATAGCGCCATCCGCTGTACCT GGtcaggtcGctggcaacttcggccgagcaggtgaacccgaaaaggtgagggtcagtgtga cacaccaaccgaacaccgacgaggcaagcgtaggagccggcgtggccgcgcccggcggcg ctgaggactcctcg
シーケンスを読み取るコードは、ここにあります。
タブ区切りで以下に示すように、適切な出力が得られます。
contig00001 586 52.38
contig00002 554 62.45
問題は、NetBeans でJTable5 つの列を持つフォームを開発したことです。
"contigID","Description","Organism","Sequence_length","Gc_percentage"
とJTextArea。上記の出力を列に表示したいのですがJTable、他の列は空のままです。で「contig00001」をクリックするとJTable、「CGGGAAAT....」のようなそれぞれのシーケンスが に表示されますJTextArea。
どうやってやるの？任意の提案をいただければ幸いです。