scanpy を使用していくつかのデータの分析に取り組んでおり、3 つのバイオリン プロットを並べてプロットしようとしていますが、うまく動作しないようです。サブプロットをいくつかの異なる方法で使用してみましたが、バイオリン プロットが間にある空のチャートが表示され続けます。いくつかの異なる戦略を試しましたが、1x3 グリッドでそれらを並べることができないようです。以下は、ヴァイオリン プロットの上に空のプロットが積み重なったプロットの一部と共に、私の最新の試みです。
plt.figure()
plt.subplot(1,3,1)
sc.pl.violin(visium, keys = 'n_genes_by_counts')
plt.subplot(1,3,2)
sc.pl.violin(visium, keys = 'total_counts')
plt.subplot(1,3,3)
sc.pl.violin(visium, keys = 'pct_counts_mt')
サンプル