ete3 のツリー内のノード番号を取得する必要があります。
ツリーの例を次に示します。
rooted_tree = Tree( "((A,B),(C,D));" )
print rooted_tree
#
# /-A
# /---|
# | \-B
#----|
# | /-C
# \---|
# \-D
次に、このツリーからいくつかのものを計算します（質問には重要ではありません）。これにより、ツリー内の各ノードの値が得られ、それをggplotツリーにプロットします。しかし、ggplot ツリーはこの情報をプロットするためにノード番号を必要とします。ここでの問題は、ツリーのノード番号を取得するためにコードを見つけることができないことです。"rooted_tree"
Aとの先祖のノード番号が欲しいとしましょうB。どうすれば取得できますか? 私はそれを行うことしか知りません：
ancestor = tree.get_common_ancestor("A","B")
しかし、のようなものancestor.numはancestor.node_number機能しません...