インタラクティブなヒートマップの特定の数のクラスターを、引数heatmaply
でできるように返したいと思います。これを行う方法はありますか?pheatmap
kmeans_k =
heatmaply
大きなマトリックスがあり、heatmaply で返されるクラスターの数を定義していない場合、ヒートマップの計算に時間がかかりすぎるか、「ベクター メモリが使い果たされました (制限に達しましたか?)」というエラーが発生します。
library(pheatmap)
data(mtcars)
mat <- as.matrix(mtcars)
pheatmap(
mtcars,
border_color = "grey20",
main = "",
show_rownames = TRUE,
show_colnames = TRUE,
kmeans_k = 30,
cluster_rows = F,
cluster_cols = F
)