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R パッケージを使用して、複数の地域から複数の分類群の出現データをダウンロードしようとしていますrgbif。私は、すべての地域をまとめて 1 つのダウンロードを行うことを好みます (何千もの地域があるため、個別にダウンロードするのは正気ではありません)。しかし、私はそうする方法を見つけられませんでした。occ_downloadクエリごとに 1 つのリージョンに対して実行できます。

これが私の例示的なコードです：

library(rgbif)
gbif_taxon_keys = c(212, 359)
# below are bbox of 3 regions;
# I have polygons as WKT, but they are clockwise 
# (how to convert to counter clockwise??)
wkts = c("POLYGON((11.3431 47.2451,11.4638 47.2451,11.4638 47.2919,11.3431 47.2919,11.3431 47.2451))",
"POLYGON((12.9644 47.7608,13.0922 47.7608,13.0922 47.8453,12.9644 47.8453,12.9644 47.7608))",
"POLYGON((14.2284 48.2217,14.3669 48.2217,14.3669 48.3443,14.2284 48.3443,14.2284 48.2217))")

# this works
queries = occ_download_prep(
  pred_in("taxonKey", gbif_taxon_keys),
  pred("hasCoordinate", TRUE),
  pred("hasGeospatialIssue", FALSE),
  pred_within(wkts[1]),
  user = gbif_user, pwd = gbif_pwd,
  email = gbif_email)
out_test = occ_download_queue(.list = list(queries))

# now try to combine regions in one download
# this does not work
queries = occ_download_prep(
  pred_in("taxonKey", gbif_taxon_keys),
  pred("hasCoordinate", TRUE),
  pred("hasGeospatialIssue", FALSE),
  pred_within(wkts),
  user = gbif_user, pwd = gbif_pwd,
  email = gbif_email)
out_test = occ_download_queue(.list = list(queries))

Error: 'value' must be length 1

# this does not work neither (it runs though)
queries = occ_download_prep(
  pred_in("taxonKey", gbif_taxon_keys),
  pred("hasCoordinate", TRUE),
  pred("hasGeospatialIssue", FALSE),
  pred("geometry", paste0(wkts, collapse = ";")),
  user = gbif_user, pwd = gbif_pwd,
  email = gbif_email)
out_test = occ_download_queue(.list = list(queries))

<<gbif download metadata>>
  Status: KILLED

GBIF のダウンロード センターから、「ダウンロード要求に失敗しました。」と表示されます。

誰でもこれを手伝ってもらえますか？ありがとう！

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