問題タブ [ropensci]
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r - install_github使用時のエラー:「exdir」は存在しません
githubからパッケージをインストールしようとしていますが、次のエラーが発生し続けます。
unzipには解凍先のディレクトリを作成する権限がないと思いますが、exdir引数にパラメータを渡す方法がわかりません。
githubからインストールするのはこれが初めてなので、本当に単純なものが欠けている可能性があります。他のパッケージ(ggplot2
)を試してみましたが、同じエラーが発生しました。
編集:からの追加結果sessionInfo()
:
TMP
、、、TMPDIR
およびTEMP
をrenviron.site経由で書き込み可能なフォルダーに設定しました。
windows - Windows OSからGitHubリポジトリへ-install_github()は機能しません-おそらくRtools関連
A:これは私が念頭に置いているプロジェクトです-(weblink)schamberlain.github.com/2012/10/rgbif-newfxns/
B:これが彼らのGitHubです-https: //github.com/ropensci/rgbif
C:私のマシン:i86-64ビット、Windows 7、R。2.15、RStudio 0.96.330
彼らの指示に従って、私は以下を実行します:
a)Rtools 2.15のダウンロードとインストール(Webリンク)cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/
この手順は私にとっては単純な魔術です。「Windowsツールセット」の付録(Webリンク)cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.html#The-Windows-toolsetに記載されている手順に従っています。
結局、私のシステムにはこの厄介なC:\ Rtoolsフォルダーがあり、PATH変数(これが何であるかはわかりません)は、付録が示唆するように設定されています(私が言える限り)。
b)Rの場合:library(devtools)
c)Rの場合:install_github( "rgbif"、 "ropensci")
これにより、通知出力が生成され、このエラーメッセージで終了します(出力のpastebin.comスニペット)。
提供された情報を手伝うことができるかどうかはわかりません。また、(a)と(b)の間に何かが欠けていると感じています-b / c後でRでパッケージ「Rtools」を見ることができません-多分それはそれがどうあるべきか、どうやって知る必要がありますか?
追加する必要があります:デフォルトのライブラリフォルダに... / Documents / R / win-library / 2.15その後、必要なすべてのファイルが含まれる解凍されたフォルダ「ropensci-rgbif-60c74ca」があります。しかし、R内からはアクセスできません。
r - comm2sci 関数が機能しない R taxize パッケージ
を使用して一般名を学名に変換しようとしてtaxize
いますが、関数がエラーを返しています。
ヘルプページから:
さらに、動作してsci2comm
いません:
彼らが働いていない理由はありますか?Rで学名を取得する他の方法はありますか?
r - Rnw ファイルに R と LaTeX コードを混在させる
Knitr を使用して .Rnw ファイルを .tex ファイルに変換するときに、学名をイタリック体にしようとしています。実行中にエラーが発生しますknit
。これは私の.Rnwファイルに含まれる私のコードです(実行する必要taxize
とstringr
ライブラリがあります):
.tex ファイルの出力は次のようになります。
この出力を .tex ファイルで取得するにはどうすればよいですか?
r - プロキシと httr vs RCurl
RCurl
ユーザーがプロキシを使用しているときと使用時の問題について聞いたことがありhttr
ますか?
一部の関数が使用し、一部が を使用するこのパッケージをtaxizeしています。ユーザーは、プロキシの詳細を渡す必要のない 2 つの関数を報告し、それらの 2 つの関数は内部的に使用されます。プロキシ認証の詳細が渡されないと機能しない一部の機能が使用されています。いずれの場合も、これらは GET 要求です。RCurl
httr
RCurl
httr
RCurl
彼女がプロキシのユーザー名やパスワードなどを必要とするときに、プロキシのユーザー名やパスワードなどを渡さなくても、何らかの方法でプロキシを処理することは可能httr
ですか? もしそうなら、それはなぜですか?
この要点には、明らかにプロキシ認証の詳細を必要とする 2 つの機能と、そうでない 2 つの機能の例があります。
r - NOAA ERDDAP データセットが見つからない場合はどうすればよいですか?
Rのパッケージを使用してグリッド化された ERDDAP データをダウンロードしようとしていますrnoaa
。一部のデータセットではデータの取得が完全に機能しますが、特に一部のデータセットのデータを取得する際に問題が発生します。たとえば、実行すると:
次のエラーが表示されます。
エラーは、さまざまな期間を試したときに時々機能するため、実際には一貫していません。noaa_pfeg_95de_54ab_a60a
しかし、データセットからデータをダウンロードしようとするたびに、 NOAA-NCDCnoaa_pfeg_1a4b_0c2a_2365
によってデータを取得します。
一部のデータセットでは機能しますが、他のデータセットでは機能しないためerddap_grid
、バグではないと思います。多分それはERDDAPサーバーの問題ですか?それとも私のAPIキーと関係があるのでしょうか? それを回避する方法はありますか?
更新 - 2015-01-10: サーバーの問題のようです。Web インターフェイスによって生成されたアドレス (以下を参照) を使用してデータをダウンロードしようとすると、同じエラーが発生します。「彼ら」がデータベースの問題を解決するまで待つ必要があると思います。