r - 「monocle3」使用時のexpression_dataに関するエラー

Question

最近「monocle3」を使い始めました。よろしくお願いします！

データの単一セル軌跡を作成しようとしていますが、次のエラーが発生し、それを回避する方法がわかりません。

cds <- new_cell_data_set(expression_matrix,
                          cell_metadata = cell_metadata,
                          gene_metadata = gene_annotation)

エラー:引数 expression_data は行列でなければなりません - Matrix パッケージからのスパースまたは密のいずれかです

このステップの前に、次のことを行いました。

expression_matrix <- readRDS('C:\\....\\nbt_loc.rds')

cell_metadata <- readRDS('C:\\....\\nbt_loc.rds')

gene_annotation <- readRDS ('C:\\....\\nbt_loc.rds')

みんなの意見に本当に感謝しています:)

乾杯、