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PyViPR の PySB インターフェイスを使用して、Human1 ゲノムスケールの代謝モデルから作成した SBML (xml) モデルを読み込もうとしています。

pyvipr.pysb_viz.sp_rxns_bidirectional_view('./mymodel.xml')

動作しません。これがエラー メッセージの最後の部分です。エンコーディングに問題があるようです:

    122         raise SbmlTranslationError(p_out.decode('utf-8') + "\n" +
--> 123                                    p_err.decode('utf-8'))

SbmlTranslationError: 
Traceback (most recent call last):
  File "<string>", line 55, in <module>
  File "<string>", line 49, in main
  File "C:\Users\proto\workspace\bionetgen\bng2\SBMLparser\build\sbmlTranslator\out00-PYZ.pyz\libsbml2bngl", line 345, in analyzeFile
  File "C:\Users\proto\workspace\bionetgen\bng2\SBMLparser\build\sbmlTranslator\out00-PYZ.pyz\sbml2bngl", line 49, in __init__
  File "C:\Users\proto\workspace\bionetgen\bng2\SBMLparser\build\sbmlTranslator\out00-PYZ.pyz\sbml2bngl", line 870, in getSpecies
AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'getListOfCompartments'
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