私は経験豊富なプログラマーではないということから始めましょう。さもなければ言及をスキップする可能性のあるステップを完全に指定できれば幸いです。
私は現在、Cytoscapeのプラグイン開発の初期段階にあり、EclipseでJavaプロジェクトを作成し、次のことを行いました。
外部ライブラリとしてcytoscape.jarを追加しました
「プログラム引数」の下の「引数」タブに「-pC:\ Program Files \ Cytoscape_v2.8.1\plugins」を追加しました
プラグインを実行しようとすると、cytoscapeがロードされますが、プラグインがインストールされていません(プラグインマネージャーに0個のプラグイン)さらに、メニューオプションが削減されています(特定のファイルをインポートできません。オプションはもうありません)
外部ライブラリとしてより多くのjarファイルを含める必要があるためだと思いますが、どれがどれかわかりません。
EclipseIndigoとCytoscape2.8.1を使用しています。
既存のプラグインのソースコードをテストプラグインとして使用しているので、プラグインコードに問題はないと思います。
ご理解とご協力をよろしくお願いいたします。
Sudipto
PS:私はすでに以下を見てあまり成功していません http://cytoscape.wodaklab.org/wiki/SettingUpEclipseForPluginDevelopment