質問を読み間違えたので編集:
newelement = element.cloneNode(true); // true to clone children too
新しいウィンドウには、追加できるhtmlまたは本文はまだありません。少なくともクロムではありません。
代わりにこれを試してください:
<html>
<body>
<script>
div = document.createElement( "div" );
// add some text to know if it's really there
div.innerText = 'text of the div';
document.body.appendChild( div );
// Here come div's atts;
render = window.open().document;
// create the body of the new document
render.write('<html><body></body></html>');
// now you can append the div
render.body.appendChild( div );
alert(render.body.innerHTML);
</script>
</body>
</html>