次のCircosダイアグラムは、説明のために SVG ファイルとしてレンダリングし、PNG に変換したものです。
外側の縁を囲むテキスト ラベルは、12 時から 9 時の方向に正しく配置され、灰色の弧から離れて外側に向いています。
9 から 12 の間では、テキスト ラベルは内側に向けられ、灰色の円弧に重なっています。これは想定外です。
問題を明確にするために、クローズアップを次に示します。
SVG の代わりに Circos から PNG を出力すると、ラベルは正しく描画されますが、Adobe Illustrator または Inkscape でベクトル形式の SVG 図をマークアップする機能が失われます。だから私はSVG出力が必要です。
circos.confラベルの追加に関連するファイルのスニペットを次に示します。
<image>
dir = /tmp
file = circos.png
png = yes
radius = 3000p
background = white
angle_offset = -176
</image>
...
<plots>
<plot>
type = text
color = black
file = factorList.txt
r0 = 1r
r1 = 1r+200p
label_size = 12p
label_font = condensedbold
padding = 0p
rpadding = 0p
label_snuggle = yes
max_snuggle_distance = 1r
snuggle_sampling = 2
snuggle_tolerance = 0.25r
snuggle_link_overlap_test = yes
snuggle_link_overlap_tolerance = 2p
snuggle_refine = yes
</plot>
</plots>
これを解決するために適用できる他のオプションがわかりません。私の質問は: SVG 出力を修正する、この構成ファイルまたは別の構成ファイルで何を試すべきですか? アドバイスありがとうございます。