MATLAB の正規表現は、「-1」などの負の整数を取りますか。このエラーが原因でコードがうまく動作していないよう"Index exceeds matrix dimensions."
で、データ ファイルの負の値と関係があることがわかっています。ワークスペース ウィンドウに負の整数が表示されます。
正規表現で負の整数を許可する方法についてのアイデア
コードは次のとおりです。
m = regexp(value, 'START=(\d+)', 'tokens');
m2 = regexp(value, 'STOP=(\d+)', 'tokens');
start = cell2mat(m{1});
stop = cell2mat(m2{1});
% Print result
fprintf(fout, 'INSERT INTO cath_domains (pdbcode, cathbegin, cathend) VALUES("%s", %s, %s)\n', domain, start, stop);