これが php のあいまいな使い方であることは承知していますが、興味深い方法でヒトゲノムをナビゲートするアイデアに取り組んでいます。
問題は、自由に利用できるデータを解析するための php スクリプトを作成できるかどうかを知る必要があることです。これを行うためのphpスクリプトはありますか?
PHPアプリケーションで探索したいデータのサブセットを含むデータベース設計(MySQL)を作成することをお勧めします。
次に、そのデータスキーマにデータをアップロードする方法を見つけます。アップロードの部分では、選択したPHPよりも強力な言語を使用できます。C#、F#、Haskellなどです。
この分離は、PHPですべてを行うよりも物事を単純化するのに役立ちます。
そのためのパーサーを作成する必要がありますが、それはかなり単純なはずです: http://jc.unternet.net/genome/2bitformat.html
Perl での例: http://www.perlmonks.org/?node_id=672251