Rでは、特異点のために一部の係数が削除された場合、vcovHC()を使用して堅牢な標準誤差を計算するにはどうすればよいですか? 標準の lm 関数は、実際に推定されたすべての係数の通常の標準誤差を正常に計算しているように見えますが、vcovHC() はエラーをスローします。
(私が使用している実際のデータはもう少し複雑です。実際、これは 2 つの異なる固定効果を使用するモデルであり、単純に取り除くことができない局所的な特異点に遭遇しました。少なくとも方法はわかりません。私が使用している 2 つの固定効果は、最初の因子には 150 レベル、2 番目の因子には 142 レベルがあり、データが 10 ブロックで収集されたという事実から合計で 9 つの特異点があります。)
ここに私の出力があります:
Call:
lm(formula = one ~ two + three + Jan + Feb + Mar + Apr + May +
Jun + Jul + Aug + Sep + Oct + Nov + Dec, data = dat)
Residuals:
Min 1Q Median 3Q Max
-130.12 -60.95 0.08 61.05 137.35
Coefficients: (1 not defined because of singularities)
Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
(Intercept) 1169.74313 57.36807 20.390 <2e-16 ***
two -0.07963 0.06720 -1.185 0.237
three -0.04053 0.06686 -0.606 0.545
Jan 8.10336 22.05552 0.367 0.714
Feb 0.44025 22.11275 0.020 0.984
Mar 19.65066 22.02454 0.892 0.373
Apr -13.19779 22.02886 -0.599 0.550
May 15.39534 22.10445 0.696 0.487
Jun -12.50227 22.07013 -0.566 0.572
Jul -20.58648 22.06772 -0.933 0.352
Aug -0.72223 22.36923 -0.032 0.974
Sep 12.42204 22.09296 0.562 0.574
Oct 25.14836 22.04324 1.141 0.255
Nov 18.13337 22.08717 0.821 0.413
Dec NA NA NA NA
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
Residual standard error: 69.63 on 226 degrees of freedom
Multiple R-squared: 0.04878, Adjusted R-squared: -0.005939
F-statistic: 0.8914 on 13 and 226 DF, p-value: 0.5629
> model$se <- vcovHC(model)
Error in bread. %*% meat. : non-conformable arguments
エラーを再現するために切り取られた最小限のコードを次に示します。
library(sandwich)
set.seed(101)
dat<-data.frame(one=c(sample(1000:1239)),
two=c(sample(200:439)),
three=c(sample(600:839)),
Jan=c(rep(1,20),rep(0,220)),
Feb=c(rep(0,20),rep(1,20),rep(0,200)),
Mar=c(rep(0,40),rep(1,20),rep(0,180)),
Apr=c(rep(0,60),rep(1,20),rep(0,160)),
May=c(rep(0,80),rep(1,20),rep(0,140)),
Jun=c(rep(0,100),rep(1,20),rep(0,120)),
Jul=c(rep(0,120),rep(1,20),rep(0,100)),
Aug=c(rep(0,140),rep(1,20),rep(0,80)),
Sep=c(rep(0,160),rep(1,20),rep(0,60)),
Oct=c(rep(0,180),rep(1,20),rep(0,40)),
Nov=c(rep(0,200),rep(1,20),rep(0,20)),
Dec=c(rep(0,220),rep(1,20)))
model <- lm(one ~ two + three + Jan + Feb + Mar + Apr + May + Jun + Jul + Aug + Sep + Oct + Nov + Dec, data=dat)
summary(model)
model$se <- vcovHC(model)