私の仕事は遺伝学で、(Matlab の) ハミング距離を使用して、ウイルスの遺伝子型間の遺伝的距離を計算しています。
例: タイプ 1 は構造 01234 を持ち、タイプ 2 は構造 21304 などを持ちます。明らかに、多くの遺伝子型が存在します。遺伝子型の長さが同じなので、ハミング距離でいいと思いました。
私の質問は次のとおりです。ハミング距離に基づいて遺伝子型を注文するにはどうすればよいですか。別の言い方をすれば、ハミング距離に基づいて遺伝子型をクラスターに分類するにはどうすればよいでしょうか?
ありがとう