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次のスクリプトを使用して、Allen Brain Atlas の神経伝達物質研究からすべての画像をダウンロードしています。

このスクリプトは、おそらくすべての利用可能な ISH 実験をダウンロードします。ただし、次のように、より多くのメタデータを取得するための最良の方法は何だろうと思っています。

1) 「遺伝子」として知られるISH 実験の種類(たとえば、画像が MBP 染色、ニッスル染色などであるかどうか)。下の赤丸で示しています。

2) 構造とアトラス画像への対応(注釈、たとえば、セクションが脳のどの部分に属しているかを確認するため)。これはで取得できると思いますが、tree_search方法がわかりません。Allen Web サイトの 2 つの異なる Web ページから下の赤い円で示されています。

3) 画像のスケール。たとえば、ダウンロードした画像の 1 ピクセルの大きさ (0.001x0.001 mm など)。たとえば、MRIに関する画像分析にはこれが必要です。以下、赤丸で示します。

上記の情報はすべてウェブサイトで何らかの方法で入手できます。私の質問は、 SDKを介してプログラムでこれを行うのを手伝ってくれるかどうかです。

編集：

また、上記のループ反復を使用しても表示されないため、「Nissl」染色をプログラムでダウンロードすることをお勧めします。写真を以下に示します。