問題タブ [blat]

私はblatツールで作業する必要があります。ゲノム内のいくつかの遺伝子の開始位置と終了位置を見つける必要があります。以下のリンクからツールをダウンロードしました: http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQblat.html、blat ファイル + blatSrc.zip ファイル。実行方法がわかりません。ユーザーガイドは以下のリンクにあります: http://genome.ucsc.edu/goldenPath/help/blatSpec.html

結果を得るためにどのコマンドを書かなければならないか教えてください。

ありがとう。

だから... ここに私の問題があります。私はコーディングの経験がかなり浅いですが、私の会社で何かを働かせようとしています。

gmail がダウンしたときにメールの停止をユーザーに通知する方法を探しているので、SMTP サーバーを介してこれを行うプログラム「Blat」を見つけました。

私は彼らのサポート文書とグーグルに目を通しましたが、これに関する方法を見つけることができません. blat を実行する最良の方法 (私が知っていることは?) は、必要な実行を含む .bat ファイルを作成することです。-to 関数 (電子メールの to: セクション) の場合、電話番号が含まれる Excel または CSV ドキュメントを呼び出す必要があります。これを行う方法はありますか？

私はこのコードを持っています:

Blat を使用して電子メールを送信しますが、エラーが発生します。

十分な引数が指定されていません

誰かが私が間違っていることを知っていますか? ありがとう。

問題: 出力ファイル「single_hits.txt」が空です:

Mac OSX 10.7.5 で使用するスクリプトを Linux からダウンロードしました。機能していないため、いくつかの変更を加える必要があります。一意のコンティグを除くすべてを除去するためにフィルタリングする必要がある DNA データの 9 つの「コンティグ」があります。blat は、2 つのデータセットを比較し、これらのコンティグを含む .pslx ファイルを出力するために使用されます。

次に、このスクリプトは、上位 2 つ (m.1) などの同一のコンティグを削除することになっています。

Python を使用して、次の BLAT 結果から不一致の位置番号を取得する方法はありますか?

ご覧のとおり、上記の出力には 2 つの不一致があります。Python を使用して不一致/突然変異の位置番号を取得できますか? ソースコードにもこのように表示されます。ということで、どう進めていくか、少し迷っています。ありがとうございました。

SMTP GMAIL の IP アドレスを教えてください (バッチ ウィンドウからメールを送信できます)。

前もって感謝します

ここにpowershellスクリプトがあります

send_report.bat は、blat を使用して電子メールを送信します

$asend_report.batに挿入するにはどうすればよいですか? $a「日報」の次の値をお願いします

コマンド ライン ツール Blat を使用して、次の HTML ページを電子メールとして送信しようとしています。

電子メールは期待どおりに送信されますが、画像が電子メール メッセージに読み込まれません。電子メールの内容は次のようになります。

ソース パスの前に「cid」を使用しようとしましたが、その場合、パスが正しく解決されないため、Web ページ自体が画像をロードしません。

使用される Blat コマンド:blat "D:\reports\mail_send_2.html" -t example@domain.com -s "email subject" -embed "D:\reports\image1.png" -embed "D:\reports\image2.png" -embed "D:\reports\image3.png" -html

ここで誰か助けてくれませんか。ありがとう ！

バッチファイルがこの問題の適切な解決策であるかどうかはわかりませんが、何をする必要があるか、これまでに何をしたかを説明します。

Robocopy をトリガーしてから Blat をトリガーするバッチ ファイルを使用して、毎日のファイル コピー タスクのログファイルをターゲット アドレスに送信します。コピーの成功または失敗に関係なく、毎日ログ ファイルを送信する代わりに、ログに失敗が存在する場合にのみログ ファイルを送信したいと考えています。

私の既存のバッチの例を以下に示します。私はプログラマーではなく、スクリプトの基本的な知識しか持っていないことに注意してください。

Robocopy 行と Blat 行の間にログファイルを読み取る何かを追加したいのですが、FAILED 列で 0 より大きい値が検出された場合は、ログファイルを自分のメール アドレスに送信し、それ以外の場合はバッチを終了します。ブラットを実行しています。

（編集）

さて、私は簡単な解決策で問題を解決しました。おそらく最も複雑な方法でアプローチしていました。Robocopy は、何か問題が発生するたびに、ログファイルに詳細なエラーの説明を提供します。私がしなければならなかったのは、「エラー」という単語のログファイルを解析するためにバットファイルを取得することだけでした。このソリューションは幅広いネットをキャストします。私はここでどんな種類のフィネスも探していないので、IF ELSE コマンドがそのトリックを行いました。