問題タブ [factoextra]

複数のグラフィックを作成して保存しようとしています。factoextraパッケージを使用してグラフを作成する場合に行き詰まります。

これは、入力 pca オブジェクト (FactoMineR パッケージを使用して作成された pca) からバイプロットを作成する単純な関数です。 out_f は事前に定義されています。スクリプトを 1 行ずつ実行すると、機能します。スクリプトとして実行すると、何も作成されません。

この場合は問題ありません。最初のケースに問題がある理由を誰かが知っていますか?

前もって感謝します、ジョン

PCA 変換後にクラスタリングを行っています。PCA 空間の最初の 2 次元または 3 次元でのクラスタリングの結果と、元の軸から投影された PCA 軸への寄与を視覚化したいと考えています。

factoextraggplotを使用するライブラリを使用していますが、正常に動作しますが、凡例を削除したいと思います。

私のコード:

右側の凡例の列を削除するにはどうすればよいですか?

ライブラリを使用しない同等のバイプロットも歓迎されるソリューションです。

PS:

3 次元でも、適切なバイプロットを取得するのは非常に簡単です。

R版を使用してい3.0.3ます。走りながら

エラーを下回っています：

このパッケージのインストール方法を教えてください。

私はRが初めてで、それを使用してPCAを実行する方法を理解しようとしています。これまでに 2 つの方法を試しましたが、どちらにも問題があります。

最初のコードは次のとおりです。

プロット出力は次のとおりです: Dim1, Dim3 プロット

これに関する私の問題は、1) 色が正しく割り当てられていることをどのように知るか、2) 楕円を追加する方法です。

これが私の2番目の方法のコードです（このWebサイトをヘルプに使用しましたが、まだ行き詰まっています）：

プロット: Dim1、Dim2 プロット

ここでの問題は、1 次元と 2 次元ではなく、以前のように 1 次元と 3 次元をプロットしたいのですが、指定方法がわからないことです。また、色を変更する方法がわかりません。

これは正しい方向に向かっているように見えますか? 可能であれば、これについて何か助けていただければ幸いです。私は自分が何をしているのか見当もつかないし、執筆に取り組んでいることになっているが、まだ分析に行き詰まっていない. また、ファイル名が「hello」など変な名前になっていて、イライラしていました。

お伺いした情報はこちら

ade4パッケージでPCA を作成してプロットし、 でカスタマイズしたいと考えていfactoextraます。でバイプロットを実現するまで、両方のパッケージで非常にうまく機能しますfactoextra。ラベルをカスタマイズする方法がわかりません。

私が書いた次のコードで誰かが私を助けることができるかどうかだけを知っています:

それは私にこのバイプロットを与えました:

変数の名前は、「biot.Conc_cocco」、「biot.conc_Crypto」ではなく、「Cocco」、「Crypto」、「Diato」とします。

あなたの答えとアドバイスをありがとう

私は現在、factomineRおよびfactoextraパッケージで pca を作成しています。

データ iris を使用したコードの例:

楕円を囲む線の幅を変更したいのですが、変数の幅も同じです。いくつかの方法を試しましたが、やりたいことを行う方法がわかりませんでした。

何か案は？

私のデータには多くの個人がいます (n=600)。PCA を実行し、変数と個体のバイプロットを作成したいと考えています。貢献度によって色分けされた変数が欲しいです。これらの個体は 2 つのグループに属しており、2 つのグループに応じてポイントに色を付けたいと思います。小さな例を添付します。

質問;

1. 行名SEBRLEとNOOLを赤で、残りを黒で色付けするにはどうすればよいですか
2. すべての行名を 2 つの要素のうちの 1 つに割り当て (これは例なのでどちらでもかまいません)、色を変えます。

部分的な回答;

しかし、私が得たところで、私は負けています。habilage と select.var の両方を contrib で使用する方法を見つけることができませんでしたError: Continuous value supplied to discrete scale。

各タイプのワイン クラス (バローロ、グリニョリーノ、バルベーラ) の機能の寄与を取得/プロットしたいと思います。fviz_contribを使用すると、以下の MWE に示すように、すべてのクラスの貢献度を取得できます。しかし、クラス/グループで個別にフィルタリングして計算/プロットできるかどうか、またどのようにできるか疑問に思っていました。