問題タブ [factoextra]

数週間、次のスクリプトを使用して、約 10,000 (ゼロ以外、正) のデータポイントを含む散布図を作成しました。変換に関する警告のため、含まれていないデータポイントはわずか (<20) です。

今週から、モデルベースのクラスタリングを行いたいと思っています。私が書いたスクリプト (以下を参照) は、同じデータセット (10,000 個のゼロ以外の正のデータポイント) を使用していますが、次の理由により、9,000 個を超えるデータポイントを除外しています。

これは 2 番目のスクリプトです。

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いくつかの追加情報:

データセットには、0 より大きい値のみが含まれます。Head(dots.Mclust) は次を提供します。

x 軸と y 軸のスケーリングを削除した後のグラフは次のようになります。どうやら、データポイントで何か問題が発生しています。データセットには負の値はありませんが、まだ 0 未満の (多くの) ポイントがあります。さらに、x 軸と y 軸はエントリ [12,] にある値をカバーしていません。これがおそらく問題の根本的な原因です。しかし、この間違った値の問題はどのように発生するのでしょうか?

ここでの根本的な問題は何ですか?

fviz_cluster を使用して、クラスター化された散布図用に次のスクリプトを作成しました。プロットによると、x には負の値、y には負の値があります。

head(dots.Mclust) (および私の徹底的な分析) によると、負の値はありません。

この不一致はどこから来るのでしょうか? fviz(cluster) はプロット上の値をどのように変更していますか? 何らかの正規化またはスケーリングが行われましたか?

fviz_ca_col() パッケージのfactoextraからコレスポンデンス分析で補足欄の色を変えようとしているのですが、色をデフォルトから変えても反応がないようですcol.col.sup = "darkred"。再現可能な例:

結果のプロットには"Alternating"、デフォルトの暗赤色の補助列があります。