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r - Rを使用してgenBankで参照/寄託されたサンプルの地理的起源を取得する方法は?
簡単な質問: R を使用して genBank で参照/寄託されたサンプルの地理的起源を取得する方法は?
ありがとう！
ペドロ
python - BioPython: GenBank の "Locus" キーで解析する方法
Genbankいくつかのシーケンスを含むファイルがあります。これらのシーケンスの名前とそれらに関するその他の情報を含む 2 つ目のテキスト ファイルが TSV にあり、これを pandas データフレームとして読み込みます。n_name以下のコード ブロックに示すように、.sample 関数を使用して、このデータから名前をランダムに選択し、変数 を割り当てました。
n_nameファイル内の Locus 名と同じで、genbank大文字と小文字が正確です。ファイルを解析して、genbankを持つシーケンスを抽出しようとしていますlocus = n_name。genbankファイルの名前はall.gb. 私は持っている：
しかし、遺伝子座で解析するには、次の行または2行がどうあるべきかよくわかりませんか? 何か案は？