問題タブ [genbank]

次のようにして遺伝子を抽出している 2 つの Genbank ファイルがあります。

これは問題なく機能しています。必要な遺伝子の配列、GC コンテンツ、および翻訳を取得できました。

2 番目の Genbank ファイルは、非常によく似た菌株です。私の考えは、新しく抽出されたシーケンスを使用することです:

2 番目の Genbank ファイルを検索するには:

ただし、明らかなように、エラーが発生しています。

bioPython の説明でこの情報を見つけようとしていますが、必要なものに似たものはありません。アライメントを実行せずにこれを行う方法はありますか?

単一のgenbankファイルを取得してヌクレオチド配列を引き出し、元のファイルに上書きするpython関数を作成しました..

それから..

これは単一のファイルに対してはうまく機能しますが、ディレクトリ内のすべてのファイルをループしてこのコマンドを実行する方法を理解する必要があります。私はしばらくPythonを使用していないので、助けていただければ幸いです。