問題タブ [heatmap]

私の質問はこれとほとんど同じです。ただし、データを明示的にビニングせずに実際のヒートマップを生成したいので、答えには満足していません。

正確には、散布データと1 / x^2などのカスタムカーネルとの間の畳み込みの結果である関数を表示したいと思います。

これをmatplotlibでどのように実装する必要がありますか？

編集：基本的に、私がやったことはこれです。結果はこちらです。軸、タイトル、ラベルなどすべてを残しておきたいです。基本的には、プロットを私が説明したように変更し、再実装はできるだけ少なくします。

'0'または'1'のいずれかを持つ多次元int配列があります。ヒートマップに似た画像を作成したいと思います。「0」の要素は1つの色になり、「1」の要素は別の色になります。例えば

こんな感じの「3×3」の画像が出ます。

ここで、白は白、rは赤を示します。

提案をありがとう。

私の人生では、なぜこの方法が失敗するのか理解できません。ここに追加の目があります。

私が得るエラーは次のとおりです：行の樹状図の順序が間違った長さのインデックスを与えました

distfunを含めないと、すべてが非常にうまく機能し、hclust関数に応答します。どんなアドバイスでも大いに感謝されるでしょう。

私はいくつかのマイクロアレイデータについてRでヒートマップを生成しようとしてきましたが、ほとんどの場合、オンラインの指示に基づいてヒートマップを作成することに成功しましたが、それは私が望むものとまったく同じではありません. 私が望むのは、ユークリッド距離ではなくピアソン距離に基づいてデータをクラスター化することですが、いくつかの問題に遭遇しました。

heatmap2 (gplots パッケージから) を使用して、次のコードを使用して最初のヒート マップを作成します。

Test402 は 402 行 (遺伝子) と 31 列 (患者) の行列で、data.test.factors は各患者が属する結果グループの指標です。ここで hclustfun を使用すると問題なく動作し、ヒートマップはメソッドの変更と全体的な動作に反応しているようです。問題は、クラスタリング距離がすべてユークリッド距離であることです。それをピアソン距離に変更したいと思います。だから私は次のことを試みます：

上記のコマンドは失敗します。これは、Test402が正方行列である必要があるためです。そこで、いくつかの追加のアドバイスを見て、次のことを試しました。

それは機能しますが、ここに問題があります。ヒートマップは、TEST402 の元の式の値ではなく、相関のみを表示するようになりました。これは私が欲しいものではありません！私はこれが欲しいのですが、デンドログラムを別の方法でクラスター化するだけで、ヒートマップで実際に表されるデータを変更したくありません! これは可能ですか？

heatmap.2 のデフォルトは、距離行列を計算するための dist と、クラスタリングのための hclust です。ユークリッド法を使用するように dist を設定し、重心法を使用するように hclust を設定する方法はありますか? 以下にコンパイル可能なコードサンプルを提供しました。distfun = dist(method = "euclidean") を試しましたが、うまくいきません。何か案は？

この記事のヒートマップとほとんど同じようにヒートマップを生成したいと思います。

http://www.gazehawk.com/blog/experienced-users-view-reddit-differently/

ヒートマップは非常に単純なPythonコードで生成されるため、この質問の答えは完全に満足のいくものではありません。これは、多数のポイントを持つ大きなヒートマップでは非常に低速です。

では、より速く、より柔軟で、より簡単なソリューションはありますか？それはどんな言語でもかまいません、私は気にしません。

Rの上三角行列または下三角行列のヒートマップをプロットする関数を提案できますか

Google マップ用に設定したヒート マップをアニメーション化できるかどうか疑問に思っていました。Google マップをセットアップしてヒート マップを追加するのは簡単でした。しかし、それはかなり退屈に見えます。ヒート マップにある種のパルス エフェクトを追加したかったのです。ありがとう

2 つの異なる列を含む Excel ファイルがあります。1 つの列には 2 から 15 の範囲の値があり、もう 1 つの列には正から負の数値の範囲の値があります。

最初の列の各値が異なる色になるようにヒートマップを作成したいと思います。2 番目の列は、グラデーションの形式にする必要があります。

これを行うためにExcelの条件付き書式を使用してみました。

しかし、Rでそれを行う方法はありますか?

10000*400タイルのヒートマップをユーザーに表示したいと思います。私のプログラムの現在の状態は、であるクラスを持っているということJComponentです。これには、タイルのJComponentインスタンスがあります。Image300 * 300のマトリックスがある場合、プログラムは800〜1000MBのRAMを使用します。これは、やりすぎ。

他に何ができるか、またはそのような大きなヒートマップを表示できるコントロールを誰かに持たせることができますか？

今日、私はをテストしました。JHeatChartこれにより、が作成されますBufferedImage。10000 *400マトリックスのサイズは400MB未満ですが、クラスで作成するには15分以上かかります。これは長すぎです。

誰かがデータを処理できるコントロールを考えているか知っていますか？