問題タブ [imagej]

Scilab と ImageJ の使用方法を学ぼうとしています。これは、コンピューター コーディング コマンドを使用してグラフやスプレッドシートなどを作成するソフトウェアです。コーディング方法を学んだことがありません。役立つ？

特定のフォルダー内のすべての画像に対して一連の操作を実行するマクロをフィジーで作成しました。しかし、私はトラブルに遭遇し、1 つの問題を乗り越えることができません。マクロを実行すると、「開いている画像がありません」というエラー メッセージが表示されます。どういう意味ですか？(入力フォルダ内の画像は .tif タイプです)

マクロは次のとおりです。

誰かが私をできるだけ早く助けてくれますか？ありがとう！

MATLAB から生成された 2 つのイメージ セットがありますimwrite。

最初の画像セットを使用してフィジーでいくつかの操作を実行しようとすると (画像 J)、動作しますが、2 番目のセットで同じことをしようとすると、「この方法で圧縮された tiff ファイルを開けません (2 ）」。インストールする必要があるプラグインはありますか?

最初のセットの imfinfo - Figure ウィンドウから saveas tif によって作成:

2 番目のセットの imfinfo - imwrite によって作成されます。imwrite(bw,fullfile(ファイル名),'tiff');

異なる蛍光チャネルで複数の画像を撮影した場合 (抗体/マーカーで細胞を染色した後)、各マーカーに対して陽性の細胞の割合を自動的に定量化するにはどうすればよいですか? Pythonでこのようなことをした人はいますか?

フィジー (ImageJ) を使用して、1 つの染色タイプのみを含む細胞をカウントすることはできますが、2 つの染色タイプを含むマージされた画像に対して選択的なカウントを実行することはできません。フィジーは python とうまくやり取りするので、1 つの染色タイプのみを含むそれぞれの画像を見て、それぞれの画像の xy 座標を取得し、それらの間の一致をチェックするスクリプトを作成することを考えていました。それが良いアイデアかどうかはわかりませんが、誰かが似たようなことをしたり、タスクを完了するためのより効率的な方法を持っているかどうか疑問に思っていましたか?

ご協力いただきありがとうございます！

私は ImageJ マクロで画像を回転させようとしているプロジェクトに取り組んでいます。基本的に関連部分は次のようになります。

したがって、上記のメソッドを実行するメソッドに対して、角度が 20、30、40、50、60 の 5 つの呼び出しを行うと、これを実行する時間が長くなります (スレッド アプリケーションとシングル スレッド アプリケーションの両方の場合)。処理期間は次のとおりです。

では、特定のマクロを連続して呼び出すと、ImageJ でのマクロ呼び出しが遅くなるのはなぜでしょうか?

I need to implement a directional weighted median filter in Java to remove random impulse noise. I have no idea how/where to start. The algorithm is as per below:

1. Create a 5x5 window
2. Consider 4 directions (vertical, horizontal, diagonal left, diagonal right) from the center pixel (5 pixels in each direction)
3. Calculate weighted difference and take the minimum value
4. Minimum value is compared to a threshold value:
   if value > threshold: it is noise pixel
   else: it is not noise pixel
5. Calculate standard deviation of the 5 pixels in each direction
6. Giving extra weight to the direction in which the standard deviation is smallest, the weighted median is computed
7. The noisy pixel is replaced with this median value
8. Move window throughout the image
9. Iterate steps 8 to 10 times

Can anybody point me in the right direction how I should go about implementing this? Any examples or implemented codes will be highly appreciated. I am using ImageJ, so any plugin that has implemented this filter (or a variation of it) will be very helpful. Thanks.

マクロを実行する必要がありますが、画像を表示したくありません。imp.show() を呼び出さない場合、ImageJ はコンソールに画像を表示します。開いている画像はありません。では、画像を表示せずにマクロを実行するにはどうすればよいでしょうか? 前もって感謝します。