問題タブ [limma]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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r - パイプライン用に文字列を R の関数の内容に変換する

私はmakeContrasts関数をパイプラインの一部として使用しています(リマを使用)。私はいくつかの研究を持っており、それらは次々とパイプラインに入れられます。そのうちの 2 つの場合、makeContrasts 関数は次のようになります。

対照は研究ごとに異なるため、パイプラインに組み込むことはできません。したがって、関数の内容を文字列に変換しました。

それでできるようになりますが、関数がそれを読み取るように文字列を解除するmakeContrasts(unstring(aarts_2))方法がわかりません。aarts_2または、これを行うためのより良い方法がある場合。これについて何か助けていただければ幸いです。

ありがとう。

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r - R ggplot (火山プロット) に色を追加しようとしてエラーが発生しました

有意性と微分表現に基づいて色付けされた火山プロットを作成したかった. Limma オブジェクトから R の toptable を使用してデータフレームを作成しました。調整された p 値と logfc に基づいて、データ フレームに色の列を追加しました。したがって、各遺伝子にも色が割り当てられ(「塗りつぶし」)、これらの色を使用してggplotを作成しました。

しかし、ggplot は適切に色付けされていません。

間違ったプロット

美学に形状を追加すると、エラーが発生します。

rlang::last_error()エラー:エラーが発生した場所を確認するために、連続変数をシェイプ Run にマップすることはできません。

これを解決する方法を知っている人はいますか? なぜこれがうまくいかないのかわかりません(Ps私はRにまったく慣れていません)

助けてくれてありがとう!!