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r - R の関数内で glmer を使用した r.squaredGLMM からエラー オブジェクトが見つかりません
glmer を使用して、R の一般化線形混合モデルから R^2 を計算する関数を作成しようとしています。どういうわけか、関数を使用しようとするとすぐにエラーが発生します:
関数なしで同じコードを使用すると、すべて問題ありません。関数内で r.squaredGLMM に一般的な問題があるかどうかをテストするために、線形混合モデルの関数も作成しましたが、これは期待どおりに機能しています。
再現可能な例を次に示します。
r - MuMin パッケージ - Dredge of Model は 15 時間後も実行中
R の MuMin パッケージで線形混合効果モデルの浚渫を実行しています。モデルは非常に大きいです (以下を参照)。
現在、ドレッジ機能は i7 プロセッサで 15 時間実行されていますが、これが正常なのかどうか疑問に思っています。このサイズのモデルには、どのような時間枠が予想されますか?
ログを確認したところ、R はクラッシュしていません。ドレッジはまだ実行されています (「特異適合」モデルが大量に生成されています)。
小さいモデルをテストしたところ、ドレッジ機能に約 1 分かかりました
小型モデル
MuMin パッケージを使用したモデル浚渫の時間枠について誰でもアドバイスできますか。ありがとうございました。
r - glmer オプティマイザを指定するとドレッジが機能しない
グローバル二項モデルでdredgeR パッケージから使用しようとしています。収束のためにオプティマイザーを指定する必要があることがわかりました。ただし、 を使用すると、エラーが発生します。モデル内の予測子の数を減らすと、仕様を削除して収束し、ドレッジを使用できます。一緒に行く方法はありますか？MuMInglmercontrol = glmerControl(optimizer="bobyqa")dredgebobyqadredgeglmerControl(optimizer="bobyqa")
glm.control(optimizer = c("bobyqa", "bobyqa"), calc.derivs = TRUE, のエラー: 未使用の引数 (optimizer = c("bobyqa", "bobyqa"), calc.derivs = TRUE, use. last.params = FALSE、restart_edge = FALSE、boundary.tol = 1e-05、tolPwrss = 1e-07、compDev = TRUE、nAGQ0initStep = TRUE、checkControl = list(check.nobs.vs.rankZ = "無視"、check. nobs.vs.nlev = "停止", check.nlev.gtreq.5 = "無視", check.nlev.gtr.1 = "停止", check.nobs.vs.nRE = "停止", check.rankX = "message+drop.cols", check.scaleX = "警告", check.formula.LHS = "停止", check.response.not.const = "停止"), checkConv = リスト(check.conv.grad = リスト( action = "warning", tol = 0.001, relTol = NULL), check.conv.singular = list(action = "メッセージ", tol = 1e-04), check.conv.hess = list(action = "警告", tol = 1e-06)), optCtrl = list())