問題タブ [nifti]
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python - nifti ファイルにディメンションを追加する
の形をした nifti ファイル (.nii) があり(112, 176, 112)ます。になるように別の次元を追加したい(112, 176, 112, 3)。しようimg2 = np.arange(img).reshape(112,176,112,3)とすると、エラーが発生します。np.reshapeまたはnp.arange他の方法でこれを行うことは可能ですか?
コード：
エラー：
r - RでNIFTIのスライスから画像パッチを抽出してpngとして保存するには?
3D NIFTI 画像のスライスから 32x32 パッチを抽出し、png として保存しようとしています。私は R で作業しています。NIFTI 画像には、240x240 ピクセルの 155 スライスが含まれています。63 番目のスライスに関心領域を配置しましたが、png としてエクスポートすると、パッチはデフォルトで 480x480 ピクセルのサイズで保存されます。コードを以下に示します。ここで、ROI は x 位置で 58:89、y で 95:126、スライス z=63 の 32x32 領域です。
エクスポートされたpngが32x32になるようにする別の方法はありますか? または、より効率的な方法はありますか？
python - 多くのデータセットの相関ヒートマップ
私は niftis (Neuroimaging 形式) を使用して、脳の 3D ボリュームを調べています。
実験を脳の活動と比較したい。
したがって、nifti 形式の実験ファイルは約 20 個あります。
4つの脳活動ファイルもnifti形式です。
それらは脳の同じ次元を持ち、脳の特定の領域/ピクセルでいくつかの値を示します。
x 軸にすべての実験、y 軸にすべてのアクティビティ ファイルを持つ sns.heatmap をプロットするにはどうすればよいですか。次に、ヒートマップの色で相関値がプロットされたヒートマップの相関マップを見たいと思います。
pandas データフレームの sns.heatmap プロットを見つけました。誰か助けてくれませんか？
私はから始めました
exp1, und act1 は次元 (57, 66, 40) の float64 として読み込まれます。
誰かがアイデアを持っていますか？
サンプルデータ: